Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSP90AB1P08238 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms