Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPBP07199 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPBP07199 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPBP07199 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPBP07199 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBP07199 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBP07199 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPBP07199 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms