Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3DP05423 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms