Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms