Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms