Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GAL3ST1Q99999 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms