Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNGAP1Q96PV0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGAP1Q96PV0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGAP1Q96PV0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGAP1Q96PV0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGAP1Q96PV0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGAP1Q96PV0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGAP1Q96PV0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGAP1Q96PV0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGAP1Q96PV0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNGAP1Q96PV0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms