Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCPIP1Q96JH7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms