Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCMH1Q96GD3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms