Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC107Q8WV48 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms