Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDPD3Q7L5L3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD3Q7L5L3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms