Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms