Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms