Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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