Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGRF1Q13972 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms