Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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