Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms