Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms