Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSME1Q06323 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSME1Q06323 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms