Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms