Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms