Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF3Q9ULT6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF3Q9ULT6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms