Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC88CQ9P219 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms