Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf78Q9NZ63 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms