Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPJQ9HC77 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms