Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ELL3Q9HB65 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms