Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LPIN3Q9BQK8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms