Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PMCHL2Q9BQD1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms