Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms