Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUQ0

CLVS1, Clavesin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1Q8IUQ0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLVS1Q8IUQ0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLVS1Q8IUQ0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms