Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BHLHA9Q7RTU4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms