Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms