Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC6Q16204 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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