Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TTF1Q15361 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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