Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTCH1Q13635 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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