Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-6■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.223e-6■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 MBNL1-214ENST00000466565 1096 ntTSL 1 (best)6.59□□□□□ -1.353e-6■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.383e-6■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 MLLT10-208ENST00000438473 1085 ntTSL 55.76□□□□□ -1.493e-6■■□□□ 14.3
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TARDBPQ13148 SLC25A36-214ENST00000515813 738 ntTSL 218.46■□□□□ 0.555e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 SLC25A36-205ENST00000502594 1163 ntTSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.475e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.285e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.055e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.045e-7■■□□□ 14.3
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TARDBPQ13148 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.585e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 EEF1AKMT2-202ENST00000464099 1013 ntTSL 1 (best)25.85■■□□□ 1.736e-11■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.386e-11■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 EEF1AKMT2-203ENST00000466270 3587 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.16e-11■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 LARP4B-202ENST00000406525 681 ntTSL 526.96■■□□□ 1.912e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 LARP4B-207ENST00000476529 613 ntTSL 314.93□□□□□ -0.022e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 LARP4B-208ENST00000481118 421 ntTSL 312.7□□□□□ -0.382e-7■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 LARP4B-203ENST00000412411 432 ntTSL 37.9□□□□□ -1.142e-7■■□□□ 14.3
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TARDBPQ13148 NUTM2A-AS1-204ENST00000417860 448 ntTSL 34.92□□□□□ -1.621e-9■■□□□ 14.3
TARDBPQ13148 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.392e-7■■□□□ 14.2
TARDBPQ13148 AATF-205ENST00000616392 474 ntTSL 29.48□□□□□ -0.892e-7■■□□□ 14.2
TARDBPQ13148 AATF-206ENST00000616434 502 ntTSL 37.17□□□□□ -1.262e-7■■□□□ 14.2
TARDBPQ13148 PIK3CB-204ENST00000462898 4747 ntTSL 516.66■□□□□ 0.262e-7■■□□□ 14.2
TARDBPQ13148 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-7■■□□□ 14.2
TARDBPQ13148 ZMYND8-209ENST00000441977 175 ntTSL 30.5□□□□□ -2.335e-7■■□□□ 14.2
TARDBPQ13148 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.577e-8■■□□□ 14.2
TARDBPQ13148 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.357e-8■■□□□ 14.2
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TARDBPQ13148 ACAP3-206ENST00000467278 2725 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.227e-8■■□□□ 14.2
TARDBPQ13148 LEPR-206ENST00000462765 2117 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.177e-8■■□□□ 14.2
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TARDBPQ13148 ACAP3-209ENST00000476572 819 ntTSL 515.59■□□□□ 0.097e-8■■□□□ 14.2
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TARDBPQ13148 PI4KA-212ENST00000484220 646 ntTSL 310.97□□□□□ -0.657e-8■■□□□ 14.2
TARDBPQ13148 LEPR-204ENST00000371059 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.677e-8■■□□□ 14.2
TARDBPQ13148 USP28-201ENST00000003302 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.797e-8■■□□□ 14.2
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TARDBPQ13148 PI4KA-205ENST00000466162 589 ntTSL 48.92□□□□□ -0.987e-8■■□□□ 14.2
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TARDBPQ13148 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.497e-8■■□□□ 14.2
TARDBPQ13148 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.567e-8■■□□□ 14.2
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TARDBPQ13148 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.967e-8■■□□□ 14.2
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TARDBPQ13148 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 SEC13-211ENST00000431352 832 ntTSL 514.25□□□□□ -0.131e-7■■□□□ 14.1
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TARDBPQ13148 SEC13-204ENST00000397099 555 ntTSL 413.93□□□□□ -0.181e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.321e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.391e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 GNGT1-205ENST00000455502 1943 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-10■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.274e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.254e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 ARPC1A-202ENST00000432786 1516 ntTSL 513.39□□□□□ -0.274e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.324e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 CSRNP1-202ENST00000514182 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.614e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 CALM2-206ENST00000482532 1891 ntTSL 210.4□□□□□ -0.744e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 ZCCHC8-210ENST00000633063 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.84e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 ZCCHC8-202ENST00000536663 1252 ntTSL 58.15□□□□□ -1.14e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 MAN1A2-204ENST00000449370 2082 ntTSL 28□□□□□ -1.134e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 ZCCHC8-205ENST00000540586 1250 ntTSL 26.66□□□□□ -1.344e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.454e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 NAP1L1-219ENST00000551500 552 ntTSL 1 (best)5.85□□□□□ -1.474e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 ZCCHC8-208ENST00000544054 1561 ntTSL 55.18□□□□□ -1.584e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.664e-7■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.84e-7■■□□□ 14.1
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