Protein–RNA interactions for Protein: Q01658

DR1, Protein Dr1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DR1Q01658 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DR1Q01658 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DR1Q01658 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DR1Q01658 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DR1Q01658 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DR1Q01658 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DR1Q01658 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DR1Q01658 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DR1Q01658 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DR1Q01658 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DR1Q01658 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DR1Q01658 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DR1Q01658 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms