Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms