Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK4P57078 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms