Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR4A2P43354 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms