Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS1P17812 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS1P17812 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms