Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SHARPINQ9H0F6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SHARPINQ9H0F6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms