Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TDRD1Q9BXT4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TDRD1Q9BXT4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms