Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms