Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms