Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL35Q6PF15 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms