Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PDLIM3Q53GG5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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