Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP21-3Q3LHN1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms