Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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