Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-215ENST00000469307 798 ntTSL 311.52□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CTSA-210ENST00000606000 644 ntTSL 311.5□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC01089-204ENST00000535643 1014 ntTSL 1 (best)11.41□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ATP6V1A-203ENST00000462855 509 ntTSL 411.4□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ITSN1-211ENST00000399355 4003 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.593e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 POGLUT1-201ENST00000295588 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PLEKHG5-204ENST00000377732 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PPFIBP2-207ENST00000527790 625 ntTSL 311.12□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.665e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C7orf49-207ENST00000477820 531 ntTSL 310.88□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C7orf49-206ENST00000472428 723 ntTSL 210.88□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 DEDD-204ENST00000463227 954 ntTSL 210.77□□□□□ -0.693e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-225ENST00000493547 1772 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.693e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 RHBDF2-205ENST00000589526 629 ntTSL 210.67□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 RHBDF2-210ENST00000591192 554 ntTSL 410.67□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ATP6V1A-205ENST00000475322 754 ntTSL 310.63□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-206ENST00000464566 726 ntTSL 310.6□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MRPL32-203ENST00000432845 2734 ntTSL 210.56□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SLC13A5-201ENST00000293800 3176 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.743e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CASP3-201ENST00000308394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.743e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ITSN1-207ENST00000399338 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AL031674.1-201ENST00000421642 486 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.763e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LRRFIP2-203ENST00000396428 1791 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-231ENST00000528216 1815 ntTSL 1 (best)10.12□□□□□ -0.793e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MSL1-208ENST00000581246 583 ntTSL 410.07□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ISG20-211ENST00000560746 730 ntTSL 39.99□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ITSN1-201ENST00000379960 3026 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-216ENST00000475884 745 ntTSL 29.84□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC00668-202ENST00000578497 545 ntTSL 49.74□□□□□ -0.853e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 POGLUT1-205ENST00000476573 567 ntTSL 49.65□□□□□ -0.863e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-217ENST00000477358 1474 ntTSL 59.59□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 DEDD-207ENST00000473679 869 ntTSL 39.33□□□□□ -0.923e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ATP6V1A-206ENST00000496747 710 ntTSL 59.2□□□□□ -0.943e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 BST2-203ENST00000533098 459 ntTSL 29.18□□□□□ -0.943e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-207ENST00000366940 5314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.943e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-228ENST00000524661 483 ntTSL 39.11□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AL031674.1-203ENST00000448013 538 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CASP3-206ENST00000523916 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.963e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC01089-212ENST00000545885 559 ntTSL 28.95□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LRRFIP2-214ENST00000481682 561 ntTSL 48.92□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-223ENST00000586199 569 ntTSL 58.8□□□□□ -13e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AGPAT5-202ENST00000518327 852 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.013e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 STMN3-205ENST00000634126 605 ntTSL 38.66□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ZNF148-202ENST00000465763 566 ntTSL 48.43□□□□□ -1.063e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.063e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CHD2-226ENST00000636881 3545 ntTSL 58.28□□□□□ -1.083e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 DDR1-242ENST00000465966 268 ntTSL 1 (best)8.15□□□□□ -1.13e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ATP6V1A-204ENST00000470455 2266 ntTSL 28.14□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PPFIBP2-213ENST00000529575 780 ntTSL 38.03□□□□□ -1.123e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 DDR1-273ENST00000513514 186 ntTSL 1 (best)8.02□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C7orf49-204ENST00000459937 2576 ntTSL 1 (best)8.01□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.134e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.134e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CLCN3-206ENST00000507875 2485 ntTSL 27.99□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.163e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CHD2-213ENST00000628118 585 ntTSL 1 (best)7.7□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.193e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-220ENST00000488947 327 ntTSL 57.51□□□□□ -1.213e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CCDC68-205ENST00000592040 708 ntTSL 37.43□□□□□ -1.223e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.243e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 OSBPL10-207ENST00000465626 473 ntTSL 27.26□□□□□ -1.253e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 OSBPL10-206ENST00000463504 533 ntTSL 47.22□□□□□ -1.253e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.273e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PPFIBP2-203ENST00000524548 407 ntTSL 37.04□□□□□ -1.283e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AGPAT5-205ENST00000530716 573 ntTSL 37.03□□□□□ -1.283e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.293e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 BTF3-204ENST00000508901 954 ntTSL 26.81□□□□□ -1.323e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.343e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.363e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.363e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.363e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.363e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.373e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 BTF3-208ENST00000514360 1177 ntTSL 26.29□□□□□ -1.43e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.413e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 BTF3-209ENST00000514505 740 ntTSL 56.2□□□□□ -1.423e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-217ENST00000477799 519 ntTSL 46.13□□□□□ -1.433e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MSL1-209ENST00000582884 580 ntTSL 56.03□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.463e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-215ENST00000471371 3171 ntTSL 1 (best)5.86□□□□□ -1.473e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-210ENST00000459825 321 ntTSL 55.85□□□□□ -1.473e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.483e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.493e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CHD2-221ENST00000635856 4236 ntTSL 55.5□□□□□ -1.533e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 DENND6A-204ENST00000477344 503 ntTSL 35.45□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 BTF3-203ENST00000507081 377 ntTSL 55.37□□□□□ -1.553e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CHD2-227ENST00000637572 4452 ntTSL 55.36□□□□□ -1.553e-6■■■■□ 25.7
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 228.6 ms